tools version new release

Certains outils sont sur des versions anciennes dans l'image singularity.

• cutadapt 4.2 -> 4.9
• diamond 2.0.15 -> 2.1.8.162
• diamond 2.0.15 -> 2.1.12
• fastqc 0.11.9 -> 0.12.1
• flye 2.9.1 -> 2.9.4
• kaiju 1.9.2 -> 1.10.1
• minimap2 2.24 -> 2.28
• multiqc 1.14 -> 1.23
• samtools 1.15.1 -> 1.20
• spades 3.15.5 -> 4.0.0

-> envisager une mise à jour + tests avant nouvelle version du pipeline ?

changed milestone to %V2.4.3 - cd_hit on proteins

added Discussion label

assigned to @philipperuiz

changed the description

changed milestone to %Add MetaMDBG

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Fusionné avec la #242

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